C-TPAT计划最初推出时，规定加入计划的进口商、清关代理、并装服务商、航运公司以及外国制造商和供应商等必须紧密合作，加强供应链各个环节的安全措施。然而，在新规定生效前，进口商的责任主要是要求其业务伙伴在供应链各环节推行C-TPAT计划的安全标准。根据新规定，进口商必须进行更多工作，确保供应链各方必须推行及遵守有关安全措施。海关边境保护局表示，参加C-TPAT计划的进口商毋须确保每宗货运均属安全，但必须证明本身一直履行责任，加强供应链的安全。
今年3月，美国海关边境保护局公布进口商申请加入海关业界合力打击恐怖主义计划(C-TPAT)的新规定，并于3月25日开始生效。虽然海关当局一直表示，C-TPAT是一项自愿性合作计划，但新规定要求有意加入计划的进口商履行更多责任。